西南大學科研團隊繪就家蠶超級泛基因組圖譜

中國教育報-中國教育新聞網訊（記者 胡航宇）10月9日，西南大學發布最新科研成果，家蠶基因組生物學國家重點實驗室團隊歷時四年，完成家蠶大規模種質資源基因組解析（“千蠶基因組”），繪就家蠶超級泛基因組圖譜。該研究在世界上率先實現家蠶基因庫數字化，創建“數字家蠶”，對于深化功能基因組研究和推進家蠶模式化，開啟家蠶設計育種，賦能“改造家蠶、多元利用”等，將產生深遠的影響。

家蠶是重要的經濟昆蟲和新興模式生物，但之前僅有單一參考基因組及部分重測序，尚不足以支撐基因組變異和優良基因的深度挖掘。家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產業技術體系首席科學家代方銀教授介紹，研究團隊對1078份蠶種質資源（205份地方種，194份改良種，632份遺傳材料，47份野桑蠶）進行了深度測序，產生55.57T基因組數據，組裝了545個蠶的高質量基因組，對100個基因組進行了基因注釋，鑒定到4300余萬個SNP、930余萬個InDel、340余萬個結構變異（SV）和7308個新基因（家族），繪制了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。

該超級泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息，是迄今全球動植物領域最大的長讀長泛基因組。同時，對蠶的各種遺傳變異、群體結構、人工選擇和生態適應性及經濟性狀開展了深入的研究，取得豐碩的創新結果。其研究論文于今年9月24日在國際名刊《自然通信》（Nature Communications）在線發表。